Да, если льгота применялась к зарплате работника до мобилизации.
Вы уже в курсе, что средний заработок мобилизованного подлежит налогообложению по зарплатным правилам, если работодатель выплачивает его «из своего кармана» и не получает в последующем бюджетную компенсацию. Соответственно, при определении суммы НДФЛ нужно учитывать, пользовался ли работник правом на НСЛ до призыва. Если да, то при условии, что сумма среднего заработка мобилизованного не превышает предельный размер дохода (в 2015 году в общем случае он равен 1710 грн.), можно применять НСЛ.
Заметьте, что консультация с таким выводом ранее содержалась в разделе 103.08.04 БЗ. Полагаем, что ее просто не успели обновить после вступления в силу Порядка № 105* (но вряд ли позиция налоговиков поменялась).
Другая ситуация, если выплата в размере среднего заработка мобилизованным работникам компенсируется из бюджета. Такой средний заработок не является зарплатой для целей НКУ. Выплата указана в освобождающем от налогообложения п.п. «и» п.п. 165.1.1 НКУ, в то время как НСЛ применяется только к зарплатным доходам, указанным в п.п. 164.2.1 НКУ. Поэтому в случае, когда вы получаете компенсацию среднего заработка мобилизованных из бюджета, речи об НСЛ быть не может.