В части выписки/регистрации той НН вы действовали в соответствии с условиями договора и НКУ. По тому периоду претензий к вам быть не может, причем не только у налоговиков, но и у покупателя. Как допсоглашение, так и просьбы о переоформлении НН вы вправе отклонить.
Но если оставить все как есть, покупателю не позавидуешь: проверяющие наверняка не захотят «принять» исходную «дато-отгрузочную» НН... ☹ Ведь согласно п. 201.10 НКУ основанием для начисления НК покупателем является должная НН, а поскольку она у него — «дато-отгрузочная», а не «дато-бюджетно-оплатная», ее попытаются «выкосить»...
Чтобы никто не пострадал ☺, вы можете согласиться с предложенным покупателем изменением условий оплаты.
Но помните: согласно п. 187.7 НКУ при поставке товаров/услуг с оплатой за счет бюджетных средств НО возникают по дате зачисления таких средств на банковский счет плательщика НДС.
Кстати, подтверждением «бюджетности» последних налоговики традиционно признают факт поступления оплаты именно с казначейского счета (101.13 БЗ).
Поскольку по одной поставке одно и то же НО не может возникать дважды, да еще и на две разные даты, у вас в налоговом учете НДС должна остаться одна дата — соответствующая п. 187.7 НКУ.
Так что же вам следует сделать?
По дате зачисления на ваш текущий счет оплаты со счета Госказначейства составить к исходной НН «обнуляющий» РК и одновременно — новую «дато-бюджетно-оплатную» НН, направить этот РК покупателю для регистрации, а эту новую НН зарегистрировать самостоятельно. Кстати, ваш лимит регистрации при этом не страдает. В результате в вашей декларации за период зачисления бюджетных средств (если РК и новую НН зарегистрировали своевременно) корректирующий «минус» в стр. 7 свернется с соответствующим «плюсом» в стр. 1.1.
