Ні, не треба.
Після того як Кабмін своєю постановою від 19.07.17 р. № 536 вніс зміни до Порядку № 569* повною мірою запрацював п. 2001.6 ПКУ.
1. У разі подання уточнювального розрахунку (УР) платник ПДВ зобов’язаний перерахувати донараховану суму податку в порядку, визначеному ст. 200 ПКУ. Тобто з ПДВ-рахунку (п. 20 Порядку № 569).
Відповідно, якщо на момент списання коштів Казначейством на ПДВ-рахунку буде сума, достатня для сплати зобов’язань за УР, додатково перераховувати кошти не доведеться.
Увага! «Старі» зобов’язання, що виникли до 01.07.15 р., потрібно погашати безпосередньо з поточного рахунку на бюджетний рахунок (п. 87.1 ПКУ).
2. Сплата ж штрафних санкцій і пені здійснюються з поточного рахунку до відповідного бюджету (п. 25 Порядку № 569).
Якщо на дату подання УР значиться переплата на бюджетному рахунку, її можна використати для погашення зобов’язань, які сплачуються з поточного рахунку безпосередньо до бюджету (у нашому випадку — «самоштраф» і пеня) (категорія 135.04 ЗІР ДФСУ).
Причому для цього жодних заяв направляти до контролюючого органу не треба — переплату в погашення зобов’язання за тим самим платежем зарахують автоматично (п.п. «а» п. 87.1 ПКУ).